Louis-Isaac Lemaistre de Sacy est emprisonné à la Bastille le 13 mai 1666 ; il y restera jusqu'au 14 novembre 1668. Il profite de ces loisirs cloîtrés pour achever la traduction de l'Ancien Testament commencée par son frère Antoine à partir de la Vulgate, et devient ainsi le maître d'œuvre d'une traduction en langue française de la Bible, dite Bible du Port-Royal ou Bible de Sacy. Après sa libération, Louis-Isaac consacre une grande partie de son temps à la révision de sa traduction et à la rédaction des Commentaires dont il veut accompagner chacun des livres de la Bible.

De 1672 à 1684, date de sa mort, Louis-Isaac Lemaistre de Sacy publie dix livres supplémentaires de la Bible. Utilisant les manuscrits laissés par de Sacy, son ami, Pierre Thomas du Fossé (1634-1698) poursuivra cette tâche, et en entreprendra la publication, étalée entre 1685 et 1693.

En 1696, paraît en 32 volumes La Sainte Bible contenant l'Ancien et le Nouveau Testament.